第二個(gè)核心問(wèn)題同樣棘手：公益性是否體現(xiàn)在工程完工后的資產(chǎn)折舊中？如考慮，亦即在工程端采取市場(chǎng)化成本定價(jià)，則到京津等核心受水區(qū)時(shí)，雖當(dāng)?shù)厮畠r(jià)已調(diào)整了十余年，但口門(mén)水價(jià)很可能仍將高于當(dāng)?shù)噩F(xiàn)行水價(jià)。

　　中央及地方政府都將面臨選擇：若不補(bǔ)貼，用水端在常規(guī)情況下棄用調(diào)水，南水北調(diào)維穩(wěn)北方地下水及生態(tài)的初衷難以實(shí)現(xiàn)；若補(bǔ)貼，則有可能出現(xiàn)“大調(diào)水、大浪費(fèi)”局面。

　　面對(duì)凡此種種，南水北調(diào)一期兩線調(diào)水最終如何定價(jià)，將是判斷這一工程真實(shí)性質(zhì)的最佳標(biāo)準(zhǔn)。

　　非計(jì)劃籌資

　　因大量財(cái)政資金被投入1998年洪災(zāi)后的重建過(guò)程，政府財(cái)力有限，通過(guò)收水費(fèi)籌措部分工程資金并大量向銀行貸款，是南水北調(diào)工程在初始階段就定下的原則。

　　這也意味著，跟以往水利工程相比，南水北調(diào)工程運(yùn)營(yíng)對(duì)水價(jià)的重視程度要更高。

　　據(jù)2002年12月由國(guó)務(wù)院批復(fù)的南水北調(diào)工程總體規(guī)劃，南水北調(diào)工程計(jì)劃投資5000億元，建設(shè)50年。其中，東中線一期工程1240億元，分別是東線320億元、中線920億元。

　　工程的三條籌資渠道為：一、中央財(cái)政資金248億元，占20%；二、地方籌集南水北調(diào)基金434億元，占35%；三、銀行貸款558億元，占45%。

　　按規(guī)劃，中央財(cái)政資金主要靠中央財(cái)政預(yù)算及國(guó)債。因當(dāng)時(shí)預(yù)算中對(duì)水利建設(shè)的總投資僅為400億元，故資金籌措重點(diǎn)是靈活的預(yù)算外國(guó)債資金。

　　2004年時(shí)，國(guó)務(wù)院又正式批準(zhǔn)成立南水北調(diào)基金，并要求受水省市按調(diào)水量承擔(dān)基金征繳費(fèi)。

　　剩余約一半資金缺口只能向銀行貸款。因利息被國(guó)家調(diào)控下降15%、銀行資金有限且不愿擔(dān)風(fēng)險(xiǎn)，最終采取銀團(tuán)貸款模式。同樣在2004年，由國(guó)開(kāi)行企業(yè)局牽頭、九家銀行組成的銀團(tuán)，協(xié)議向工程貸款558億元。

　　但這一籌資框架并未實(shí)施到底。受?chē)?guó)家補(bǔ)償政策變更、工程量增加、物價(jià)上漲及利息等因素影響，到2005年?yáng)|中線一期工程可行性研究報(bào)告編制完成時(shí)，建設(shè)資金總量比總體規(guī)劃翻了一番，達(dá)到2546億元。