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藏族人群三代測序高質量參考基因組發(fā)布
記者28日從中科院昆明動物研究所獲悉,國際期刊《國家科學評論》雜志日前在線發(fā)布了由中國科學院昆明動物研究所、西藏大學等聯(lián)合攻關完成的第一個藏族人群高質量參考基因組,這是藏族人群高原適應研究的又一階段性成果,對解析藏族人群基因組中的大片段結構變異對高原低氧環(huán)境的遺傳貢獻有著重要意義。
為了系統(tǒng)解析藏族人群全基因組上的大尺度結構變異,中科院昆明動物研究所宿兵研究員與西藏大學歐珠羅布教授、上海營養(yǎng)與健康研究所徐書華教授和青海省高原醫(yī)學科學研究院吳天一院士等合作,利用三代長讀長測序技術以及多種輔助組裝技術,從頭組裝了一個高質量的藏族人參考基因組——珠峰1號。
相比于目前已有的人類參考基因組,珠峰1號具有更好的序列連續(xù)性和完整性。利用這個基因組,研究人員找到了17900個大尺度結構變異,其中6505個是有別于其他兩個東亞人的大尺度結構變異。經過分析發(fā)現(xiàn),這些特有的變異相關基因的功能顯著富集在一個重要的低氧通路上。此外,他們還發(fā)現(xiàn)了一個發(fā)生在基因內含子上的163bp缺失,這個缺失在藏族和漢族群體中表現(xiàn)出顯著的頻率差異,且該缺失與藏族較低的肺動脈壓顯著相關。
編輯:劉暢
關鍵詞:基因組 藏族人 人群 參考