近日，國際醫(yī)學期刊《癌癥研究》刊發(fā)四川大學華西醫(yī)院院長李為民教授及謝丹教授團隊相關研究文章，該研究整合染色質開放測序（ATAC-seq）、全基因組測序、轉錄組測序技術，通過對50例非小細胞肺癌組織開展多組學測序，發(fā)現了不同病理類型的肺癌具有各自獨特的染色質開放區(qū)域特征。李為民表示，這揭示了肺癌復雜的基因調控網絡，對未來開發(fā)新的肺癌靶向藥物奠定了重要基礎，有助于推動建立新的肺癌治療方法和干預模式。

李為民介紹，近年來，肺癌基因組測序研究已揭示部分基因突變與肺癌之間的關聯，但仍有一部分肺癌患者沒有明顯的驅動基因突變，而是在表觀遺傳層面發(fā)生了改變。其中，染色質開放區(qū)域是一項重要的表觀遺傳學特征；開放染色質的存在往往意味著相應DNA調控元件的激活，可以調控下游基因表達。鑒于復雜的基因調控模式，整合基因組、轉錄組、表觀遺傳組等多組學數據，從多層面揭示肺癌復雜的基因調控網絡具有重要意義。

研究發(fā)現，肺鱗癌特有的開放區(qū)域出現在上皮細胞角質化過程有關的基因周圍；早期肺腺癌特有的開放區(qū)域出現在與預后有關的基因周圍。而且，研究者在肺癌樣本中發(fā)現了一些較寬的開放區(qū)域分布，這些特殊的開放區(qū)域主要在基因的轉錄起始位點附近出現富集，他們不但表現出癌種特有的分布特征，還與基因表達的混亂程度相關。這一現象提示，寬開放區(qū)域可能參與了腫瘤基因調控紊亂的過程。

該研究發(fā)現了21個與基因組開放區(qū)域及轉錄本表達調控有關的數量性狀座位。研究還證實了此前肺癌全基因組關聯分析研究中提出的，與肺癌風險相關的位點參與基因組調控網絡的模式。這些調控位點及調控模式，可以作為肺癌診斷及藥物設計的靶標，指導肺癌的精準化治療。