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埃博拉宿主內(nèi)進(jìn)化研究獲突破
由中國科學(xué)院微生物研究所、中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院、首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院等單位科研人員合作開展的埃博拉病毒宿主內(nèi)進(jìn)化研究取得重大突破。該研究首次系統(tǒng)地揭示了埃博拉病毒在宿主內(nèi)的進(jìn)化模式,重新闡明了病毒基因中重要變異位點(diǎn)在“病毒—宿主”相互影響中的作用,為抗病毒藥物研發(fā)設(shè)計(jì)藥物靶標(biāo)提供了新依據(jù)。該研究論文近日在線發(fā)表在《自然·微生物學(xué)》雜志上。
該論文并列第一作者、首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院傳染病研究所陳晨博士介紹,研究團(tuán)隊(duì)采用擴(kuò)增子深度測序,并為此開發(fā)了一套全新的生物信息學(xué)分析流程,通過對135個(gè)樣本的測定,第一次發(fā)現(xiàn)了埃博拉病毒在宿主內(nèi)進(jìn)化過程中曾經(jīng)產(chǎn)生的710個(gè)單核苷酸變異位點(diǎn)。
“如果說人體內(nèi)有10000個(gè)埃博拉病毒,運(yùn)用傳統(tǒng)的分析研究方法,只有當(dāng)體內(nèi)6000個(gè)甚至8000個(gè)病毒發(fā)生變化時(shí)才能監(jiān)測到病毒變化,而通過此次設(shè)計(jì)的生物信息學(xué)分析流程,只要人體內(nèi)2個(gè)~5個(gè)病毒發(fā)生變化就能監(jiān)測到?!标惓拷榻B,借助方法學(xué)的突破,可以在臨床上更早、更精準(zhǔn)地發(fā)現(xiàn)病毒變異,為后期用藥提供指導(dǎo)。同時(shí),研究團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn),病毒VP40基因受到了強(qiáng)烈的負(fù)選擇,這為抗病毒藥物設(shè)計(jì)提供了新靶點(diǎn)。
中國科學(xué)院微生物研究所劉文軍研究員認(rèn)為,本研究“從個(gè)體內(nèi)種群變異這一嶄新角度,解讀了病毒的進(jìn)化規(guī)律,是宿主內(nèi)進(jìn)化這一病毒學(xué)前沿領(lǐng)域的重大突破”。
據(jù)介紹,在公共衛(wèi)生領(lǐng)域,該研究可為埃博拉疫情暴發(fā)提供評估依據(jù);在臨床研究方面,高通量檢測技術(shù)的快速普及,可推動臨床新發(fā)傳染病控制和傳染病精準(zhǔn)用藥。(通訊員王燕 記者孫夢)
編輯:趙彥
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