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重新發(fā)明馬鈴薯
▲黃三文在觀察馬鈴薯性狀
▲馬鈴薯果實(shí)與種子
▲黃三文和團(tuán)隊(duì)成員一起收獲馬鈴薯
▲2020年黃三文帶著馬鈴薯雜交種子拜訪袁隆平院士
習(xí)近平總書(shū)記高度重視國(guó)家糧食安全,提出:“要圍繞保障糧食安全和重要農(nóng)產(chǎn)品供給集中攻關(guān),實(shí)現(xiàn)種業(yè)科技自立自強(qiáng)、種源自主可控,用中國(guó)種子保障中國(guó)糧食安全。”
馬鈴薯是我國(guó)第四大主糧作物。我們研究團(tuán)隊(duì)在國(guó)家大力、穩(wěn)定、長(zhǎng)期支持下,得以在農(nóng)業(yè)基因組學(xué)領(lǐng)域持續(xù)開(kāi)展底層科研,進(jìn)行原始創(chuàng)新,完成了馬鈴薯的種子繁殖技術(shù)突破,使我國(guó)在馬鈴薯育種基礎(chǔ)理論和技術(shù)上站在了世界領(lǐng)先地位。
機(jī)緣巧合做對(duì)關(guān)鍵選擇
我從事馬鈴薯育種研究,始于2000年。那一年,我到荷蘭瓦赫寧根大學(xué)植物科學(xué)學(xué)院植物育種系攻讀博士學(xué)位,算起來(lái)到如今已有24年。
我的導(dǎo)師是埃弗特·雅各布森教授,他是著名的馬鈴薯遺傳育種專(zhuān)家,也是我們學(xué)院院長(zhǎng)。從面積上看,荷蘭是農(nóng)業(yè)小國(guó),但從實(shí)力上來(lái)講,特別是在馬鈴薯相關(guān)研究領(lǐng)域,荷蘭卻是全球數(shù)一數(shù)二的強(qiáng)國(guó)。20多年前,我國(guó)馬鈴薯產(chǎn)量是1噸/畝,而荷蘭是3噸/畝,荷蘭的種薯出口量占到全球的85%。整體來(lái)說(shuō),科研水平高,實(shí)力雄厚。
讀博結(jié)束前,我還沒(méi)確定未來(lái)在哪個(gè)細(xì)分方向進(jìn)行深入研究,現(xiàn)在回想起來(lái),有三件事決定了我后來(lái)要走的路。
第一件事發(fā)生在2004年,時(shí)任中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所所長(zhǎng)楊煥明應(yīng)邀到瓦赫寧根大學(xué)授課。那次學(xué)習(xí)讓我意識(shí)到基因組學(xué)在農(nóng)業(yè)基礎(chǔ)生物學(xué)研究中將發(fā)揮重要作用,因此,“基因組”這個(gè)神秘的現(xiàn)代生物技術(shù)一下子吸引了我,由此在我心里埋下了一顆種子。
第二件事是有感于一篇文章。當(dāng)時(shí)一位英國(guó)教授將一篇發(fā)表在《自然綜述:遺傳學(xué)》雜志上的文章寄給我,文章名為《1930年代的生物技術(shù)》,講述了美國(guó)在20世紀(jì)初進(jìn)行玉米雜交育種的詳細(xì)過(guò)程。我深受觸動(dòng),當(dāng)時(shí)就在想:是否也能讓馬鈴薯從塊莖繁殖變?yōu)殡s交種子繁殖?
這個(gè)想法在當(dāng)時(shí)看來(lái),簡(jiǎn)直是異想天開(kāi)。以人來(lái)舉例,人屬于二倍體,一倍體來(lái)自于父親,另外一倍體來(lái)自于母親。野生的馬鈴薯是二倍體,但在人類(lèi)馴化過(guò)程中突變成了四倍體,也就是說(shuō)馬鈴薯有四套染色體。這導(dǎo)致馬鈴薯種子高度分離,從四倍體上收集的種子再播種下去之后,長(zhǎng)出來(lái)的樣子可能千姿百態(tài),很難保持優(yōu)良性狀。
第三件是荷蘭瓦赫寧根大學(xué)發(fā)起成立了國(guó)際馬鈴薯基因組測(cè)序協(xié)作聯(lián)盟,研究目的是獲得完整確切的馬鈴薯基因組序列。這個(gè)聯(lián)盟不能沒(méi)有中國(guó)人的身影,于是我與時(shí)任中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院副院長(zhǎng)的屈冬玉(現(xiàn)任聯(lián)合國(guó)糧食及農(nóng)業(yè)組織總干事)聯(lián)系,向他介紹了這個(gè)聯(lián)盟開(kāi)展的相關(guān)工作,提出中國(guó)研究團(tuán)隊(duì)?wèi)?yīng)該參與進(jìn)來(lái)。
屈冬玉對(duì)此非常認(rèn)可,并親自帶隊(duì)來(lái)到荷蘭,他作為項(xiàng)目發(fā)起人之一,通過(guò)引進(jìn)人才和橫向聯(lián)合組建了中國(guó)馬鈴薯基因組測(cè)序團(tuán)隊(duì),而我則成為中方首席科學(xué)家,負(fù)責(zé)項(xiàng)目的組織和執(zhí)行。
這是促成我從事馬鈴薯雜交育種研究的直接原因。
當(dāng)然,如果從更遠(yuǎn)的時(shí)間點(diǎn)上追溯,還有另外一顆“種子”。上世紀(jì)80年代初,改革開(kāi)放以后包產(chǎn)到戶,我家里一直種植水稻,有一年水稻產(chǎn)量突然提高一倍,從約400斤/畝提高到約800斤/畝。我很吃驚,并問(wèn)父親這是怎么回事,父親說(shuō)是種了袁隆平的雜交水稻品種。當(dāng)時(shí)我印象非常深刻,可以說(shuō),我后來(lái)走上農(nóng)業(yè)科研這條路,在一定程度上是受到袁老的影響。
搬走研發(fā)路上的兩座大山
全球約有100多個(gè)國(guó)家、13億人口以馬鈴薯為主要口糧,馬鈴薯也是我國(guó)第四大主糧作物。
很多人想象不到,對(duì)人類(lèi)如此重要的食物來(lái)源,從數(shù)千年前印第安人開(kāi)始種植馬鈴薯,到幾百年前我國(guó)引進(jìn)馬鈴薯,都是用馬鈴薯薯塊種植,從未有過(guò)改變。
相比種子繁殖,這種通過(guò)薯塊進(jìn)行繁殖的方式存在很多弊端。首先它的繁殖系數(shù)很低,僅為1:10,相當(dāng)于收獲10個(gè)土豆,人們就需要留下一個(gè)作為“種子”,極大地增加了種植成本。其次,一般而言,種一畝地只需2克種子,而種薯薯塊就需500斤左右,對(duì)農(nóng)民來(lái)說(shuō),運(yùn)輸、儲(chǔ)存都成為問(wèn)題。而且薯塊相比種子,沒(méi)有外殼保護(hù),無(wú)法進(jìn)行表面消毒,容易傳染病蟲(chóng)害。三是無(wú)性繁殖作物的品種更新速度非常慢,很多國(guó)家常被用來(lái)制作薯?xiàng)l的馬鈴薯還是在100多年前選育的品種,這在水稻領(lǐng)域是不可想象的。水稻幾乎每十年就更新一代,品種能夠得到不斷改良。
為什么不用比薯塊更節(jié)省成本的種子來(lái)種植馬鈴薯呢?全球一流農(nóng)業(yè)育種專(zhuān)家都在研究這個(gè)課題。
這是一項(xiàng)巨大的工程。在植物界,馬鈴薯、紅薯、甘蔗等通過(guò)地下莖或分蘗繁殖,叫無(wú)性繁殖;另外一類(lèi)進(jìn)行有性繁殖,也稱為種子繁殖,如水稻、小麥、玉米等。要把無(wú)性繁殖改為種子繁殖,不是簡(jiǎn)單的修修補(bǔ)補(bǔ)、對(duì)個(gè)別基因進(jìn)行修改就能完成的。因?yàn)榛蚪M是所有基因的總和,科學(xué)家要對(duì)整個(gè)基因組進(jìn)行選育,從底層創(chuàng)新,系統(tǒng)性重建,真的很難。
在2006年至2008年底,荷蘭發(fā)起的國(guó)際馬鈴薯基因組測(cè)序聯(lián)盟就遇到了巨大困難:基因組高度雜合、物理圖譜質(zhì)量不高、測(cè)序成本太高等。2008年時(shí),我已經(jīng)掌握了新一代基因組測(cè)序技術(shù),并用這項(xiàng)技術(shù)完成了黃瓜的基因組測(cè)序工作,現(xiàn)在看來(lái)這也是一次練兵的過(guò)程。于是我向聯(lián)盟提出:以單倍體馬鈴薯為材料來(lái)降低基因組分析的復(fù)雜度,并采用快捷的全基因組鳥(niǎo)槍法和新一代的DNA測(cè)序技術(shù)。
沒(méi)想到,提議遭到了荷蘭方面的拒絕。
今天看來(lái),這次拒絕給了中國(guó)一次絕佳的機(jī)會(huì):我們作為發(fā)起方,聯(lián)合美國(guó)、英國(guó)研究團(tuán)隊(duì)以及國(guó)際馬鈴薯中心一起開(kāi)展相關(guān)工作。中國(guó)在這個(gè)過(guò)程中實(shí)現(xiàn)了身份的轉(zhuǎn)換:從國(guó)際協(xié)作聯(lián)盟的參與者轉(zhuǎn)變成了課題的主導(dǎo)方。
我們?cè)诓婚L(zhǎng)的時(shí)間內(nèi)完成了馬鈴薯基因組序列圖的構(gòu)建,發(fā)表在著名的《自然》期刊上。
有了基因組,就可以考慮開(kāi)展雜交馬鈴薯育種了。
然而,在馬鈴薯雜交育種的道路上,還存在很多困難,主要有兩個(gè):
一是自交繁殖難,因?yàn)樽越徊挥H和:二倍體馬鈴薯是天然異交物種,自己跟自己授粉結(jié)不了種子,即自交不親和。要想解決這個(gè)問(wèn)題,就要找到控制自交不親和的那組基因,敲掉他;或者找到來(lái)自野生種的自交親和基因,就可徹底解決這個(gè)問(wèn)題,這對(duì)后期產(chǎn)業(yè)化種植推廣非常重要。
為了攻克這個(gè)難關(guān),我們借助基因組學(xué)方面的優(yōu)勢(shì),對(duì)眾多種質(zhì)資源進(jìn)行篩選。我常常這樣形容基因組學(xué)在生物學(xué)研究中的價(jià)值:以前我們好似在黑暗的房間尋找一把鑰匙,光源非常有限,基本什么也看不到,需要去摸索?,F(xiàn)在有了基因組學(xué),通過(guò)全面揭示物種的基因組,相當(dāng)于打開(kāi)了房間的燈,找到鑰匙就成為了可能。
自交衰退是第二道難關(guān),它是指生物在自交之后出現(xiàn)生理機(jī)能的衰退。這就好比近親不能結(jié)婚,否則會(huì)導(dǎo)致很多遺傳疾病。由于長(zhǎng)期無(wú)性繁殖,馬鈴薯累積了大量隱性有害突變。一旦自交后,這些突變就會(huì)顯現(xiàn)出來(lái)。識(shí)別和淘汰這些有害突變就是我們一直在做的事。
從2013年開(kāi)始,我們一直致力于破除上述兩個(gè)結(jié)構(gòu)性障礙。
破譯遺傳基因密碼
2015年,在中國(guó)農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程、深圳市和云南省的大力支持下,我們開(kāi)始推進(jìn)“優(yōu)薯計(jì)劃”,目標(biāo)是:通過(guò)雜交育種技術(shù),將育種周期從10~12年縮短為3~5年,同時(shí)把繁殖系數(shù)提高1000倍。
直到2021年,我們終于取得了突破性進(jìn)展,培育了兩個(gè)完全純合的自交系,我們真正把馬鈴薯變成了種子作物。這在世界上是第一例。
2021年6月24日,《細(xì)胞》雜志在線發(fā)表了我們團(tuán)隊(duì)的研究成果:“Genome design of hybrid potato(雜交馬鈴薯的基因組設(shè)計(jì))”。我們培育出的第一代高純合度(>99%)自交系和雜交品系“優(yōu)薯1號(hào)”,在試驗(yàn)田的產(chǎn)量接近2噸/畝,具有顯著的產(chǎn)量雜種優(yōu)勢(shì),同時(shí)還具有干物質(zhì)含量高和類(lèi)胡蘿卜素含量高的特點(diǎn),蒸煮品質(zhì)都很不錯(cuò)。
對(duì)種子繁殖的水稻、玉米、小麥來(lái)說(shuō),100%的純合度都不是問(wèn)題,但對(duì)于馬鈴薯來(lái)說(shuō),99%的純合度,已實(shí)屬不易,這是在技術(shù)不斷進(jìn)步之下才得以實(shí)現(xiàn)的?!皟?yōu)薯1號(hào)”的成功選育,證明了雜交馬鈴薯育種的可行性,使馬鈴薯遺傳改良進(jìn)入了快速迭代的新階段。
其實(shí),在此之前一年的11月,我?guī)е蚪M設(shè)計(jì)育種獲得的第一代二倍體馬鈴薯雜交種子,專(zhuān)程拜訪了當(dāng)時(shí)還在世的袁隆平院士,向他詳細(xì)介紹了“優(yōu)薯計(jì)劃”研究取得的突破性進(jìn)展。袁老聽(tīng)取匯報(bào)后十分開(kāi)心,專(zhuān)門(mén)為“優(yōu)薯計(jì)劃”題詞:“馬鈴薯雜交種子繁殖技術(shù)是顛覆性創(chuàng)新,將帶來(lái)馬鈴薯的綠色革命”。袁老是我們農(nóng)業(yè)科研人員的英雄,他的鼓勵(lì)對(duì)我們團(tuán)隊(duì)意義重大!
雖然這時(shí)已取得了階段性成績(jī),但馬鈴薯基因組中的有害突變問(wèn)題還沒(méi)有解決,馬鈴薯長(zhǎng)勢(shì)還比較弱,品種仍需進(jìn)一步改良,需要繼續(xù)找到并淘汰未被發(fā)現(xiàn)的有害突變。
我們通過(guò)基因組大數(shù)據(jù),開(kāi)發(fā)了一個(gè)可以有效鑒定有害基因的進(jìn)化“透鏡”技術(shù)。針對(duì)近百份物種資源進(jìn)行分析,觀察它們?cè)?000萬(wàn)年的進(jìn)化過(guò)程中哪些基因沒(méi)有突變、哪些容易突變。這個(gè)技術(shù)相當(dāng)于給了育種專(zhuān)家一雙“火眼金睛”,可以在早期就淘汰掉不好的材料,把育種效率提高50%以上,這也是“優(yōu)薯計(jì)劃”的關(guān)鍵一步。
在這個(gè)過(guò)程中,我們發(fā)現(xiàn)了一個(gè)有意思的現(xiàn)象:傳統(tǒng)育種使用生長(zhǎng)更加健壯的馬鈴薯作為自交系起始材料的做法,可能會(huì)南轅北轍,將導(dǎo)致選育過(guò)程中子代從父母本中獲得更多的有害突變。相反,生長(zhǎng)較弱的馬鈴薯遺傳給子代的有害突變更少,后期的自交育種成功率更大。
這個(gè)“不選壯苗選弱苗”的反直覺(jué)方法不僅顛覆了以往的認(rèn)知,而且還能夠提早2~3年預(yù)測(cè)馬鈴薯的自交系育種結(jié)果,快速創(chuàng)建更多優(yōu)良馬鈴薯自交系,進(jìn)而培育更多馬鈴薯雜交品種。
回顧過(guò)去這些年的研究歷程,可以說(shuō)我們?cè)诿恳粋€(gè)研究環(huán)節(jié)都使用了基因組分析技術(shù),因此有國(guó)外同行評(píng)價(jià)我們:幾乎是從零開(kāi)始徹底改造馬鈴薯,讓馬鈴薯育種進(jìn)入了現(xiàn)代育種時(shí)代?!都?xì)胞》雜志評(píng)價(jià)這些成果已經(jīng)成為“植物基因組設(shè)計(jì)的藍(lán)圖”,德國(guó)、英國(guó)科學(xué)家也提出“這是馬鈴薯的重新發(fā)明”。
團(tuán)隊(duì)攻關(guān)力量大
上述成績(jī)的取得,離不開(kāi)整個(gè)研究團(tuán)隊(duì)的辛勤付出,幸運(yùn)的是,我們有一支非常團(tuán)結(jié)奮進(jìn)的隊(duì)伍。
張春芝是第一個(gè)被我“忽悠”參加“優(yōu)薯計(jì)劃”的成員。因?yàn)闅夂蜻m宜,云南一年四季都可以種植馬鈴薯,這里也成為我們主要的研究基地。為了更好地投入科研工作,張春芝和她愛(ài)人長(zhǎng)期駐扎在這里,領(lǐng)導(dǎo)一個(gè)小組和當(dāng)?shù)氐暮献骰锇橐黄鹈刻毂疾ㄔ谔镩g地頭。張春芝的遺傳學(xué)基礎(chǔ)很好,對(duì)馬鈴薯分子育種理解很深刻。這些年,她不僅培育了兩個(gè)品系:“優(yōu)薯1號(hào)”和“優(yōu)薯1.1”,還生了兩個(gè)娃,可以說(shuō)是事業(yè)和家庭“雙豐收”。
云南師范大學(xué)馬鈴薯研究院的院長(zhǎng)尚軼教授原本是我們北京團(tuán)隊(duì)的成員,主要從事分子生物學(xué)研究。2017年,為了雜交馬鈴薯事業(yè),他們舉家搬到了昆明,那個(gè)時(shí)候孩子才上小學(xué)。剛到云南,人生地不熟,要做的事情非常多。當(dāng)然,尚軼的到來(lái)是對(duì)張春芝育種工作的有力支持,他的研究領(lǐng)域是馬鈴薯營(yíng)養(yǎng)品質(zhì)、風(fēng)味形成分子機(jī)制,他和張春芝兩個(gè)團(tuán)隊(duì)相互配合,將國(guó)家資源和地方優(yōu)勢(shì)充分結(jié)合起來(lái),一起助力將馬鈴薯雜交育種的夢(mèng)想變?yōu)楝F(xiàn)實(shí)。
如今,尚軼到云南也有7個(gè)年頭了,平臺(tái)和團(tuán)隊(duì)已經(jīng)搭建完成,擁有3000多平方米的實(shí)驗(yàn)室,馬鈴薯研究院的成員超過(guò)150人。接下來(lái)就是圍繞雜交馬鈴薯計(jì)劃關(guān)鍵科學(xué)問(wèn)題進(jìn)行進(jìn)一步科研攻關(guān),同時(shí)組建馬鈴薯產(chǎn)業(yè)化團(tuán)隊(duì),構(gòu)建全產(chǎn)業(yè)鏈發(fā)展體系,從品種選育、綠色種植到下游高附加值產(chǎn)品開(kāi)發(fā)等環(huán)節(jié)充分體現(xiàn)科技含量。
相比其他科研領(lǐng)域,農(nóng)業(yè)基礎(chǔ)研究周期長(zhǎng),我們團(tuán)隊(duì)這些優(yōu)秀的科研人才把他們最寶貴的年華都奉獻(xiàn)給了馬鈴薯育種事業(yè)。在田間,他們每年都要種植幾十萬(wàn)株馬鈴薯,觀察他們的性狀,選擇優(yōu)良的育種材料?;氐綄?shí)驗(yàn)室,還要進(jìn)行馬鈴薯基因組數(shù)據(jù)分析,進(jìn)行大量的實(shí)驗(yàn)操作解析重要性狀的分子機(jī)制,科研任務(wù)繁重。但他們始終充滿活力和創(chuàng)新精神,敢于探索未知、?勇于挑戰(zhàn)困難。在追求事業(yè)發(fā)展的過(guò)程中,他們個(gè)人價(jià)值也得到了實(shí)現(xiàn),尚軼入選了教育部長(zhǎng)江學(xué)者,張春芝獲得了國(guó)家自然科學(xué)基金委優(yōu)秀青年基金的資助。
對(duì)于我來(lái)說(shuō),我的使命不僅是要把雜交馬鈴薯的事業(yè)做成,還要培養(yǎng)一批優(yōu)秀的年輕科學(xué)家和育種家,他們是農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新的重要力量,是實(shí)現(xiàn)國(guó)家種業(yè)振興、農(nóng)業(yè)強(qiáng)國(guó)建設(shè)的重要人才支撐。
中國(guó)科技創(chuàng)新成果惠及世界
“優(yōu)薯1.1”是我們?cè)谌ツ晖瞥龅钠废?,多個(gè)指標(biāo)比“優(yōu)薯1號(hào)”提高很多,但還不到生產(chǎn)田的水平。生產(chǎn)田種植對(duì)產(chǎn)量、抗性等方面要求更高,但我相信這個(gè)目標(biāo)很快就能實(shí)現(xiàn)。到那個(gè)時(shí)候,種植馬鈴薯的農(nóng)民一定會(huì)喜歡這個(gè)新種子,老百姓們也將吃到更多適合自己口味的新品種。與此同時(shí),馬鈴薯雜交種子的大規(guī)模應(yīng)用,還將給馬鈴薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展帶來(lái)一場(chǎng)革命性變化,運(yùn)輸和儲(chǔ)藏成本大大削減,以育種為主的研發(fā)型企業(yè)也將不斷涌現(xiàn)。
作為中國(guó)第四大主糧作物,馬鈴薯實(shí)現(xiàn)種子繁殖更為重要的意義是:將為保障國(guó)家糧食安全和重要農(nóng)產(chǎn)品的穩(wěn)定供給提供強(qiáng)有力的科技支撐。不僅中國(guó)人受益,其對(duì)廣大發(fā)展中國(guó)家、“一帶一路”共建國(guó)家來(lái)說(shuō)也是一個(gè)福音。我們已經(jīng)和國(guó)際馬鈴薯中心、盧旺達(dá)等有關(guān)國(guó)家成立了國(guó)際全球雜交馬鈴薯聯(lián)盟,通過(guò)舉辦培訓(xùn)班等形式幫助有需要的國(guó)家共同發(fā)展,造福當(dāng)?shù)匕傩铡?/p>
作為研究人員,我們也深刻感受到,基因組學(xué)是生命科學(xué)領(lǐng)域蓬勃發(fā)展的新興學(xué)科,在農(nóng)業(yè)基礎(chǔ)生物學(xué)研究中發(fā)揮著引領(lǐng)作用,也為生物種業(yè)發(fā)展帶來(lái)新的機(jī)遇。我們看到,近十年的中央一號(hào)文件,幾乎年年提及扶持種業(yè)創(chuàng)新、加強(qiáng)生物技術(shù)基礎(chǔ)研究和開(kāi)發(fā)。我們?nèi)〉玫倪@些成果就是國(guó)家整體科研實(shí)力不斷提升的一個(gè)投射。
早在2013年,在財(cái)政部、原農(nóng)業(yè)部等的支持下,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院就啟動(dòng)了科技創(chuàng)新工程,目的是以機(jī)制創(chuàng)新撬動(dòng)院所改革,以穩(wěn)定支持增強(qiáng)創(chuàng)新能力,我們就是受益者。與此同時(shí),深圳市基礎(chǔ)研究機(jī)構(gòu)和廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究重大項(xiàng)目,也對(duì)我們雜交馬鈴薯項(xiàng)目進(jìn)行了長(zhǎng)期穩(wěn)定的支持。
毋庸置疑,正是黨和國(guó)家對(duì)基礎(chǔ)研究的高度重視和戰(zhàn)略布局,使得廣大科研人員勇于去挑戰(zhàn)最底層的技術(shù)、開(kāi)展長(zhǎng)周期的原始創(chuàng)新。如今,一批批先進(jìn)、高效、實(shí)用的重要農(nóng)業(yè)科技成果頻出,為推動(dòng)我國(guó)農(nóng)業(yè)科技整體水平躍升、加快實(shí)現(xiàn)農(nóng)業(yè)農(nóng)村現(xiàn)代化提供了強(qiáng)有力的科技支撐。
全國(guó)政協(xié)委員、中國(guó)科學(xué)院院士、中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院院長(zhǎng) 黃三文 口述 邢艷嬌 整理
編輯:廖昕朔