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AI識別出290個新蛋白質家族
據瑞士巴塞爾大學官網20日報道,該校和瑞士生物信息學研究所(SIB)的科學家借助機器學習技術,識別出了290個新的蛋白質家族和一個類似花朵形狀的新蛋白質折疊。相關論文發(fā)表于最近的《自然》雜志。
交互式網絡“蛋白質宇宙圖譜”。圖片來源:巴塞爾大學生物中心
在過去幾年里,“阿爾法折疊”徹底改變了蛋白質科學。這種人工智能工具利用科學家在過去50多年收集的蛋白質數據進行訓練,能夠高精度預測蛋白質的3D形狀,去年對2.15億種蛋白質進行了建模,幾乎可以提供任何蛋白質形狀的信息,為科學家更好了解蛋白質進化歷程提供了幫助,但在蛋白質研究領域,仍有很多秘密等待揭示。
研究團隊此次構建了一個由5300萬個蛋白質組成的互動網絡——蛋白質宇宙圖譜,以更好地大規(guī)模預測未知蛋白質家族及其功能。在此基礎上,研究團隊識別出290個新的蛋白質家族和一個類似花朵形狀的新蛋白質折疊。
研究人員指出,使用基于深度學習的工具在“蛋白質宇宙圖譜”中尋找未知蛋白質,為生命科學的創(chuàng)新鋪平了道路?!暗鞍踪|宇宙圖譜”有助研究更多蛋白質,而了解蛋白質的結構和功能是開發(fā)新藥或通過基因編輯工具改變蛋白質功能的第一步。
編輯:馬嘉悅