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人類病毒組多樣性變化模型發(fā)表

2021年05月10日 09:23  |  來源:科技日報(bào)
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科技日報(bào)昆明5月9日電 (記者 趙漢斌) 作為人類微生物菌群的重要組成部分,病毒大量存在于人體口腔、皮膚、肺、胃腸道、血液甚至腦脊液中。記者9日從中科院昆明動物研究所獲悉,該所計(jì)算生物與醫(yī)學(xué)生態(tài)學(xué)組利用最新成果,建立了人類病毒組多樣性變化模型。

病毒幾乎遍布地球的每個(gè)角落。在人體中,它們以病毒群落形式存在,這些病毒群落的集合即為人類病毒組。

“與腸道菌群中的細(xì)菌相比,病毒數(shù)量是細(xì)菌的10倍以上,可高達(dá)萬億。人類病毒群落包括內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒、感染人類細(xì)胞的真核病毒、感染細(xì)菌的噬菌體和感染古菌的病毒。”學(xué)科組負(fù)責(zé)人馬占山研究員介紹說,人體病毒群落與宿主間存在協(xié)同進(jìn)化,因而存在著復(fù)雜的相互作用。

現(xiàn)有研究發(fā)現(xiàn),人體病毒組與許多疾病間存在著緊密的聯(lián)系,疾病可能會影響病毒組的多樣性及其組成;同時(shí),病毒組的改變也會反過來影響疾病的發(fā)病與進(jìn)程。這些疾病不僅包括如艾滋病、埃博拉出血熱和流行性感冒等由病毒感染直接引發(fā)的病毒源性疾病,還包括如囊性纖維化、牙周疾病、炎癥性腸病等非病毒源性疾病。近期,學(xué)科組博士生肖琬蒙應(yīng)用馬占山提出的“多樣性—面積關(guān)系”分析方法,首次獲得了人類病毒群落多樣性在個(gè)體間的異質(zhì)性、群體水平的潛在多樣性,以及局部病毒群落多樣性在全球病毒宏群落中所占的比值,并探究了疾病對這些參數(shù)的影響。

該模型顯示,通常疾病對人類病毒群落在個(gè)體間多樣性異質(zhì)性的影響并不顯著,反而潛在病毒多樣性在健康對照組與患者間可能存在顯著差異。同時(shí),上述比值參數(shù)、人體病毒群落的比值參數(shù)要遠(yuǎn)大于細(xì)菌群落。

研究結(jié)果提示,盡管我們體內(nèi)病毒個(gè)體數(shù)量是細(xì)菌數(shù)量的10倍,但從群體角度看,每個(gè)人對全球病毒多樣性的貢獻(xiàn),反而要比對細(xì)菌多樣性的貢獻(xiàn)高。國際期刊《遺傳學(xué)前沿》在線發(fā)表了這一研究結(jié)果。


編輯:魯雅靜

關(guān)鍵詞:病毒 人類 類病毒 病毒組 群落


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